这里的魔法不是神话和童话里面的魔法，而是高科技发展了一个多世纪之后，在人类当中存在有的现实当中的魔法。有一些少男少女被上帝选中了，拥有施展魔法的能力，而他相应的教育机构也建立起来了，叫做国立魔法大学附属第一高中。有魔力的少男少女们，要进入这所学校就读。司波深雪是一名非常漂亮并且没有缺点的完美优等生，升学梦想着和一同入学的哥哥打野过上高中生活但是挡在他面前的是一科生和二科生、也是优等生和劣等生之间的高墙。哥哥达也毫不意外就是那个劣等生，他爱慕哥哥之心胜过了自己的心情，深雪的视角描绘的是另一个魔法科高中也是阶级森严的高中。最后他凭借自己的优秀打破了这所高中森严的规律和哥哥在一起了